25 De março de 2013 — O primeiro multi-gene teste de sequenciamento de DNA que pode ajudar a prever respostas dos pacientes com câncer para tratamento foi lançado no serviço nacional de saúde (NHS), graças a uma parceria entre cientistas da Universidade de Oxford e Oxford University hospitais NHS Trust.
O teste utiliza as mais recentes técnicas de sequenciamento de DNA para detectar mutações em 46 genes que podem estar dirigindo o crescimento do câncer em pacientes com tumores sólidos. A presença de uma mutação em um gene potencialmente pode determinar qual o tratamento a paciente deve receber.
Os pesquisadores dizem que o número de genes testados um passo alterar introdução a tecnologia de seqüenciamento de DNA de última geração no NHS e anuncia a chegada de Medicina Genômica com o seqüenciamento do genoma dos pacientes ao virar da esquina.
O teste de seqüenciamento gênico de muitos foi lançado através do Instituto Nacional para investigação de saúde (NIHR) Oxford biomédica pesquisas centro (BRC), uma colaboração entre Oxford University hospitais NHS Trust e da Universidade de Oxford para acelerar a inovação de cuidados de saúde, e que foi parcialmente financiado esta iniciativa.
Centro de diagnóstico Molecular da CVB realiza o teste. O laboratório, com base nos hospitais da Universidade de Oxford, cobre todos os pacientes de câncer na área do Vale de Tamisa. Mas os cientistas estão olhando para scale-up em um serviço verdadeiramente nacional de NHS no decorrer deste ano.
O novo teste de £300 poderia poupar significativamente mais em custos de drogas por recebendo pacientes para tratamentos direito imediato, reduzir o dano de efeitos colaterais, bem como o tempo perdido antes de chegar a um tratamento eficaz.
'Nós somos os primeiros a introduzir um teste de diagnóstico multi-gene tumor perfilando no NHS usando a mais recente tecnologia de seqüenciamento de DNA,' diz o Dr Jenny Taylor do centro Wellcome Trust de genética humana na Universidade de Oxford, que é diretor do programa de Medicina Genômica no NIHR Oxford BRC e esteve envolvido no trabalho. ' É uma mudança de passo significativo da maneira que fazemos as coisas. Esse teste de gene novo 46 afasta-nos métodos convencionais para o seqüenciamento de genes única e marca um passo enorme para seqüenciamento de genoma mais abrangente em duas infra-estruturas e no tratamento de dados produzidos.'
Dr Anna Schuh, que dirige o centro de diagnósticos moleculares do BRC e é um hematologista consultor em hospitais de Universidade de Oxford, acrescenta: «pacientes gostam da idéia de um teste que pode prever e dizer, na frente, se eles vão responder a um tratamento tóxico. O que o paciente vê não é diferente do presente. Uma biópsia é retirada o tumor do paciente para teste genético com um consultor falando através dos resultados, alguns dias mais tarde. É parte do processo diagnóstico normal.'
Câncer é descrito frequentemente como uma doença genética, uma vez que a transição de que uma célula passa por se tornar cancerosas tende a ser impulsionado por mudanças no DNA da célula. E cada vez mais, novas drogas câncer dependem de saber se uma mutação em um único gene está presente em células de câncer do paciente.
Por exemplo, um paciente de câncer de pulmão pode ter uma biópsia para verificar se há alterações no gene EGFR. Se houver uma mutação, o paciente, em seguida, pode ser tratado com uma droga que funciona como um inibidor do EGFR. Se não houver nenhuma mutação, tais drogas não vai funcionar e o paciente gostaria de obter um fármaco diferente que seria mais eficaz para eles. Saber que a presença ou ausência de mutações em um determinado gene pode escolher o caminho de tratamento para esse paciente.
O NHS pode atualmente teste de mutações em genes de 2 ou 3 - genes chamados BRAF, EGFR ou KRAS - usando a tecnologia de seqüenciamento mais antiga que tem sido ao redor por décadas. Estão a ser feitos esforços para olhar para o aumento do número de genes do câncer seqüenciados para nove como padrão.
Os cientistas de Oxford são os primeiros a fazer tais testes multi-gene possível no NHS usando as últimas técnicas de sequenciamento de DNA. O serviço NHS que eles lançaram olhares de mutações em genes de 46, e agora estão trabalhando no sentido de verificar o uso de um teste envolvendo 150 genes.
Ter um teste de diagnóstico ou 'painel' que pode tela de mutações em vários genes ao mesmo tempo será importante para o acesso a todas as novas drogas de câncer que estão chegando ao longo.
'Vai ser muito difícil de gerenciar em laboratórios de diagnósticos de NHS sem painéis de gene,', explica o Dr Schuh. ' Atualmente, novas drogas câncer tendem a obter aprovação ao lado de um teste de diagnóstico específico para aquela droga que pode determinar quais pacientes se beneficiarão. Mas como mais e mais drogas como esse vir, possivelmente não pode executar que todos os muitos diferentes separam testes, isso poderia significar. Precisamos de um teste para uma variedade de drogas.'
Dr Taylor acrescenta: "nós queríamos um teste que usaria as últimas técnicas de sequenciamento de DNA para detectar uma grande variedade de mutações em uma ampla gama de genes. Um teste que seria capaz de cobrir mais tratamentos, tudo por um custo semelhante aos métodos convencionais e cancros mais.'
O teste é executado em uma plataforma de seqüenciamento de geração próxima da Life Technologies Corporation, chamado de máquina de genoma pessoal o íon (PGM(TM)). O teste e software de acompanhamento foram substancialmente modificados conforme solicitado pela equipe de Oxford para cumprir as normas de diagnósticos em seu laboratório.
Este trabalho foi co-financiado pelo Conselho de estratégia de tecnologia, Agência de inovação do Reino Unido, através de uma concessão à NIHR Oxford BRC, Life Technologies Corporation, AstraZeneca e Janssen de investigação & desenvolvimento, LLC, uma das empresas farmacêuticas Janssen.
Como parte do teste de desenvolvimento, a equipe de Oxford procurou para melhorar a preparação inicial da amostra no laboratório, e fornecer o suporte de software e infra-estrutura para manipular e analisar a quantidade de informação envolvida. O mais importante, o grupo de Oxford realizou testes e comparações para verificar a robustez da técnica com biópsias de câncer diretas de pacientes.
A equipe comparou o novo teste de 46 gene contra técnicas convencionais para 80 biópsias de câncer consecutivos no fluxo de trabalho do laboratório do hospital.
O método de sequenciamento de DNA de geração detectou todas as mutações que o método convencional; ele detectou novas mutações que não pelo método convencional; e detectadas mutações presentes em níveis muito inferiores nas amostras. O tempo necessário para o teste de 46 gene também equipado para o tempo de retorno padrão para amostras no laboratório.
Não há benefício definitivo na seleção alguns dos 46 genes incluídos no teste; há provável ou provável benefício clínico na seleção de alguns dos outros; mutações em genes ainda podem ser importantes em alguns tipos de câncer, mas não outros; e os outros genes, não sabemos ainda. Mas ter essa informação significa pesquisadores pode investigar se uma mutação tem significado biológico.
'Podemos manter dados, banco-la e vinculá-lo com microdados dados clínicos sobre câncer de pacientes para pesquisas futuras,' explica Dr Schuh.
O teste procura mutações nas regiões de 'hotspot' de cada gene - áreas onde as mutações são mais prováveis de ocorrer. Isso significa que o teste pode perder até 5% das mutações, que podem ocorrer em outros lugares, mas este é ainda significativamente melhor do que a taxa de 'falso negativo' usando métodos atuais.
Ele também pode detectar mutações presentes em apenas 5% das células tumorais presentes em uma amostra. Isso é muito mais baixo do que atualmente é possível e é importante ser capaz de capturar informações de células presentes em apenas pequenas quantidades em um tumor, mas que ainda são importantes no crescimento do câncer.
Ter mostrado que é possível introduzir o 46 gene teste como um serviço do NHS, os investigadores estão agora a avançar para investigar o potencial de um teste que será seqüência 150 genes. A equipe irá utilizar o teste sobretudo com 500 amostras existentes de doentes que participam em ensaios clínicos de câncer para ser capaz de comparar os resultados retrospectivamente com informações dos ensaios. Eles então usará o teste com 1000 novas biópsias de câncer para entender melhor como as informações adicionais poderiam ser utilizadas na orientação de tratamentos para pacientes e seus resultados.
Dr Schuh diz: ' testes de "Painel" têm um potencial significativo enquanto aguardamos o custo do seqüenciamento de genomas todo pacientes para descer. Mesmo assim, painel de testes podem ser com a gente por algum tempo. Após o seqüenciamento do genoma inteiro entrou em uso, pode ser que painel de testes são usados primeiramente com biópsias dos pacientes, com apenas aqueles cujo painel teste mostra nenhum resultado tendo seu DNA todo sequenciado para procurar alterações genéticas raras.'
Lord Howe, Ministro da saúde, disse: ' queremos estar entre os melhores países do mundo no tratamento do câncer e sei que o melhor adaptados cuidados para pacientes potencialmente poderiam salvar vidas.
' Saúde investigação como isso é extremamente importante e congratulo-me com o podemos apoiar o trabalho dos investigadores em Oxford por meio do Instituto Nacional de saúde investigação centro de investigação biomédica.
'Traduzindo rapidamente os achados da pesquisa genética em benefícios reais para os pacientes, seu trabalho irá certificar que pacientes obter tratamentos direito imediatamente, reduzem os efeitos colaterais potenciais e também nos ajudam a utilizar mais eficazmente os fundos de NHS.'
O painel de 46-gene baseia-se na química do íon AmpliSeq(TM) da Life Technologies Corporation. O teste requer uma quantidade muito pequena de DNA (5 nanogramas), uma vantagem quando se trabalha com amostras clínicas que normalmente são limitadas na quantidade.
A máquina de genoma pessoal do íon (PGM(TM) e AmpliSeq(TM) de íon são para pesquisa Use apenas, não deve ser utilizado em procedimentos de diagnóstico. Tecnologias da vida pretende prosseguir a designação de CE-IVD para PGM.
Nota: Os materiais podem ser editados para conteúdo e comprimento. Para mais informações, entre em contato com a fonte citada acima.
Disclaimer: Este artigo não pretende fornecer aconselhamento médico, diagnóstico ou tratamento. Opiniões aqui expressados não refletem necessariamente os da ScienceDaily ou seus funcionários.
Via: Novo motor de busca concebido para ajudar os médicos e o público no diagnóstico de doenças raras
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